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科学研究

 基因表达差异研(yan)究

数字PCR可以提供比实时荧光定(ding)量(liang)PCR更精(jing)确的(de)基(ji)(ji)因差异表达(da)研究,尤其对于那些(xie)靶(ba)基(ji)(ji)因表达(da)差异微小的(de)情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的(de)表达(da)分析;等位(wei)基(ji)(ji)因的(de)不平衡(heng)表达(da);单细胞基(ji)(ji)因表达(da)分析;外泌体核酸分子定(ding)量(liang)分析等。

低(di)丰度DNA模板分子的精确定量

由于(yu)(yu)绝(jue)大(da)部分(fen)微(wei)液(ye)(ye)滴(di)(di)中(zhong)只含(han)单(dan)(dan)个或不(bu)含(han)模板分(fen)子(zi),使得低丰度(du)DNA模板分(fen)子(zi)的(de)扩(kuo)增不(bu)受高(gao)丰度(du)模板分(fen)子(zi)扩(kuo)增的(de)竞争抑(yi)制(zhi)(zhi),与(yu)此同时(shi),样本中(zhong)可(ke)能存在(zai)的(de)抑(yi)制(zhi)(zhi)剂也在(zai)分(fen)配到微(wei)液(ye)(ye)滴(di)(di)的(de)过程中(zhong)进(jin)行了相对稀释,作用于(yu)(yu)单(dan)(dan)个微(wei)液(ye)(ye)滴(di)(di)内模板扩(kuo)增的(de)抑(yi)制(zhi)(zhi)剂数量大(da)幅降低,因此可(ke)应(ying)用于(yu)(yu)诸多临床样本(如血液(ye)(ye)、尿液(ye)(ye)粪便、痰(tan)液(ye)(ye)、胸腹(fu)水(shui)、脑脊液(ye)(ye)等)中(zhong)痕(hen)量核酸(suan)标(biao)记(ji)物的(de)检(jian)测(ce)。一(yi)般(ban)而(er)言,定量PCR的(de)检(jian)测(ce)灵敏(min)(min)度(du)约(yue)在(zai)1%,NGS的(de)灵敏(min)(min)度(du)可(ke)达到1%,而(er)数字PCR的(de)检(jian)测(ce)下限可(ke)轻松(song)实现0.01%。

拷(kao)贝数变(bian)异(CNV)研(yan)究

数(shu)字(zi)(zi)PCR直接读取阳性信号,通过(guo)泊松分布校(xiao)正得到目标基(ji)因(yin)的绝(jue)对拷(kao)贝数(shu),为拷(kao)贝数(shu)变(bian)异的研究提供了绝(jue)对的检测精度。采用数(shu)字(zi)(zi)PCR能够有效对二代测序(NGS)和微阵(zhen)列比较(jiao)基(ji)因(yin)组杂交aCGH等(deng)实验结果(guo)进行验证,并(bing)具有检测周(zhou)期短、成本低、样本通量高等(deng)特点。

甲基(ji)化含量鉴(jian)定

传(chuan)统的(de)亚硫酸(suan)氢盐处(chu)理后的(de)克隆测序法 抗体检测法 定(ding)量PCR检测法等受限于方(fang)法学的(de)问(wen)题,不(bu)能(neng)获得甲(jia)基(ji)化(hua)程(cheng)度的(de)精(jing)确定(ding)量,而数字PCR系统通过(guo)对(dui)样本的(de)微液滴处(chu)理及目标分子的(de)绝对(dui)拷贝数定(ding)量,为甲(jia)基(ji)化(hua)程(cheng)度的(de)精(jing)确定(ding)量检测提供了一种可(ke)靠的(de)技(ji)术。

基因编辑结果验证

CRISPR-Cas9技(ji)(ji)术的发明,是(shi)基(ji)因编辑(ji)技(ji)(ji)术的一大突(tu)破,但(dan)如(ru)何验(yan)证实验(yan)是(shi)否成功,仍需要(yao)高灵敏度的检测方法,数(shu)字(zi)PCR技(ji)(ji)术可以满足这一需求。